Undervisning: mikroskopi

Som doktorand undervisar jag ju på 20% av min tid, bland annat på första kursen i Cellbiologi. Förutom att titta på illustrationer med lådor och pilar så skär vi också i grönsaker.

IMG_0025

Det här behövs: diverse grönfoder, färglösningar, mikroskop, objekts- och täckglas. Det går utmärkt att fotografera rakt ner i mikroskopet, men jag är ganska usel på det. Får öva mig under kursens gång och dra nytta av studenternas förmåga att göra preparat.

IMG_0035

IMG_0037

Blad av Elodea (vattenpest). Nedan två (mycket fula) preparat av bananer med och utan Lugols jodlösning. Om någon cellbiologistudent läser detta, tag lärdom. Vi kan få betydligt snyggare bilder än såhär:

IMG_0030

IMG_0031

Första artikeln: Hönsens kammar, ben och gener

Hurra! Vår artikel A Sexual Ornament in Chickens Is Affected by Pleiotropic Alleles at HAO1 and BMP2, Selected during Domestication kom ut för några veckor sedan i PLoS Genetics. ”Vi” i det här fallet är ett ganska stort gäng i Linköping och Uppsala. Jag befinner mig i Linköping i AVIAN-gruppen, jobbar med Dominic Wright och det här är den första artikeln som jag är förstaförfattare på; jag är väldigt glad för den och entusiastisk över nästa sak vi håller på med.

Det handlar om genetisk kartläggning av kamstorlek i korsningar mellan tama och vilda höns — röda djungelhöns och vit leghorn. Syftet med korsningen är att studera hönsens domesticeringsgenetik, alltså vilka genetiska skillnader som gör att tama och vilda höns skiljer sig. Kamstorlek är särskilt intressant för att kammen är ett sexuellt ornament hos höns. (Det har vi inte själva tittat på i det här arbetet, men det finns annan forskning som funnit att både tuppar och hönor hellre parar sig med en partner som har stor kam.)

Hur sådana ornament fungerar och varför de förekommer finns det lite olika hypoteser om. Här finner vi en länk mellan kammen och ben — kamstorleken korrelerar positivt med mängden medullärt ben, som i sin tur är känt som kalciumreserv för höns som producerar äggskal. Det verkar alltså som att en stor kam signalerar en kalciummetabolism som är lämplig för hög äggproduktion.


(Figur 3 ur artikeln. Licensierad under Creative Commons Attribution-licens.)

Dessutom isolerar vi två närliggande gener, BMP2 och HAO1 på hönans kromosom 3, som har en (eller flera närliggande) genetiska varianter som påverkar kam och ben. Vi kan ringa in området där den underliggande varianten — vilken den nu är — bör finnas till en region emellan generna. Där finns det också en sekvens med som visar tecken på att vara selekterad under domesticeringen. Vi har (ännu) inte kunnat hitta den exakta genetiska varianten som ligger bakom.

Själva artikeln är öppet tillgänglig och kan läsas på PLoS Genetics hemsida.

Dessutom har den fått en hel del uppmärksamhet (vetenskapskommunikation är, som den minnesgoda läsaren om inte annat märkt på mitt en smula tjatiga klagande, inte det lättaste — men även om nedanstående artiklar ibland har lite annan inriktning än jag väntat mig, tycker jag de är rätt bra):

Vetenskapsradion — som vanligt med referens till originalartikeln.

TT — DN, m fl.

Corren — se min handledare med en kyckling på huvudet.

Daily Mail

National Geographic — Tales of the Weird

ps. Vet inte om jag ska skämmas eller vara stolt över att min karriär börjar med ett ”storleken har betydelse”-pressmeddelande. Härnäst: ”ägget kom först”.

Sorkrelationer och krönikor som havererar

För ett par veckor sen skrev Elin Grelsson Almestad en krönika om biologisk forskning. Den bygger på en TT-text, som kan läsas till exempel i DN. Jag skriver om den av två anledningar: 1) den nämner ett av de intressantaste exemplen på när en känd genetisk variant orsakar (ja, orsakar!) en skillnad i beteende — i det här fallet mellan olika arter av sorkar; 2) den är ett exempel på hur svepande och konstigt det blir om en ska kritisera forskning utifrån TT-texter.

Det här är lite vad jag tänker:

  • För det första känns det sådär att vara någon tomte på internet som kritiserar Elin Grelsson Almestad. Där är man (så!) nog i ganska dåligt sällskap. Överhuvudtaget känns det som ett typiskt exempel på populär/vetenskapens saga: en vetenskapare säger eller skriver något käckt spekulativt som är vagt relaterat till hens forskning men är tänkt att väcka intresse (för väldigt många verkar tro att folk i allmänhet inte är intresserade av vad forskningen handlar om, utan bara dess mest dramatiska potentiella konsekvenser); en journalist skriver ett referat eller ett referat av ett referat i en nyhetsartikel; en politiskt och samhällsvetenskapligt orienterad krönikör parodierar referatet och lägger till en sensmoral om naturvetenskapens världsfrånvändhet; någon bloggare (jag) rycker ut på en käpphäst till vetenskapens försvar … Suck.
  • Såklart håller jag rätt mycket med om Elin Grelsson Almestads kritik av TT-artikeln. Den ger heller ingen ordentlig källhänvisning varken till New Scientist-artikeln den refererar — jag tror att det kan vara den här (kostar pengar att läsa) —  eller den vetenskaliga artikeln (om sorkar) som nämns.
  • Som många intressanta projekt har sorkforskningen ifråga genererat en bunt artiklar. Nyhetsartikeln nämner en studie publicerad i Neuroscience, och det finns minst två, men den som avses är antagligen: Pitkow m fl. (2001)  Facilitation of Affiliation and Pair-Bond Formation by Vasopressin Receptor Gene Transfer into the Ventral Forebrain of a Monogamous Vole. Neuroscience 15 ss. 7392-7396. Beskrivningen av experimentet i TT-artikeln är inte så dum: Det finns en receptor för hormonet vasopressin vars uttrycksmönster som skiljer sig mellan sorkarter med olika parningsbeteende (en monogam och en promiskuös art). Artikeln beskriver ett genterapiliknande försök som visar att mer vasopressinreceptorer gör sorkhanar mer intresserade av att stanna med en hona de sovit i samma bo som — och tyder alltså på att det är en skillnad i uttryck av just den här genen som förklarar åtminstone en del av beteendeskillnaden.
  • Jag ska inte kritisera Anders Sandbergs och Julian Savulescus debattartikel, för jag har inte läst den. Men något som framgår tydligt redan av TT-texten är att de själva inte jobbar på något piller mot skilsmässa. Och det gör, såvitt jag vet och kan bedöma av deras artikel, inte sorkforskarna heller. Aders Sandberg jobbar på Future of Humanity Institute i Oxford och Julian Savulescu på Oxford Centre for Neuroethics. Med all respekt för deras arbete inom beräkningsbiologi och etik — som jag inte gjort någon ansats att sätta mig in i — är det rätt klart att de inte berättar om pågående utveckling av en medicin utan föreslår en spekulativ tillämpning av forskning som handlar om något annat.
  • Elin Grelsson Almestad tycker tydligen att förslaget är ett etiskt haveri. Det kanske det vore. Men ett provokativt förslag från två futurister är en dålig grund prata om dålig biologisk vetenskap. Slutet av krönikan tangerar också en typ av kritik som jag gör mig irriterad: när vi vet att en massa andra faktorer spelar roll för mänskligt välbefinnande, då är det tydligen slöseri med tid att forska på hur relationer och parbindning fungerar (vilket jag tror är en bättre beskrivning av vad sorkforskningen ovan kan åstadkomma). Om en resonerar så, hur avgör en då vilken forskning som är viktig och värdig — och kommer det alls finnas utrymme för att göra något annat än tillämpad medicinsk forskning?
  • Till sist, om sorkresultaten alls ska tillämpas på mänskliga relationer, så är det obligatoriskt att hänvisa till Lisa Grubb:

(Även om vasopressinreceptorerna i sorkarnas hjärnor har väldigt lite med njurarna att göra.)


Vad får man om man multiplicerar sex med sju? How many roads must a man walk down? Biologins tråkiga stora frågor.

”En groende avundsjuka märks ibland hos biologer över fysikernas förmåga att få uppmärksamhet”, skriver Ulrika Björkstén på SR, såvitt jag kan se grundat på absolut ingenting mer än en formulering i Nature häromsistens. Där föreslog Heidi Ledford fyra stora frågor inom biologin att betrakta som jämförbara med partikelfysikernas jakt på Higgs-bosonen.

Frågorna lyder: ”Finns det utomjordiskt liv? Finns det okänt liv på jorden? Hur uppstod livet? Och kan vi hindra åldrandet?”

Det som utmärker de här fyra frågorna, tycker jag tralala, är att de är så ointressanta: kanske med undantag av åldrandet är de rätt allmänt hållna, och  de är väldigt långt från vad som gör mig exalterad och inspirerad — och det är jag åtminstone inte helt ensam om.  Men om du har några exempel på bra spännande astrobiologi, till exempel, får du gärna skicka dem till mig; jag är inte sämre än att jag kan ändra mig!

Om vi ska föreslå några stora egna frågor som både är svåra, viktiga och intressanta varierar det garanterat mellan olika fält av biologi. Men mitt förslag på en fråga skulle nog lyda typ:

Vad är de molekylära förklaringarna till den saknade heritabiliteten i mänsklig längd (eller personlighet)?

Både längd och resultat på personlighetstester (som de så kallade stora fem) har i allmänhet hög heritabilitet (en avsevärd del av variationen inom mänskliga populationer är ärftlig), men kartläggningar hittar ytterst få genetiska varianter som kan förklara den. Och förresten — liknar inte det här sökandet efter den där bosonen, i alla fall på ett ytlligt plan? Vi har teorier som säger att gener och alleler i fråga måste finnas — men det kommer krävas tunga studier och en hel del påhittighet och metodutveckling för att verkligen hitta dem.

De signaler som hittas har i allmänhet liten effekt, så antagligen är det fråga om en stor mängd varianter som var och en har en ytterst liten effekt. Vi vet påfallande lite om sådana små varianter, om hur allelerna fungerar molekylärt, hur de interagerar och hur de bidrar till evolutionär anpassning. Rymden eller livets uppkomst i all ära, men det är sånt som gör mig entusiastisk!

A note on using R: Residuals from a linear model with missing values

(Not på svenska: Det här är något jag kanske kommer göra då och då — skriva en liten praktiskt inriktad kommentar om något jag upptäckt i arbetet med något visst (oftast datorbaserat) verktyg — något jag skulle velat hitta när jag googlade problemet.)

(This is something I might do more often: posting a small practical thing I’ve found useful, as an attempt to help a fellow user who’s trying to google his or her way to a solution.)

Occasionally when analysing data, you feel the need to pull out the residuals from a linear model — e.g. when trying to control for a bunch of covariates. In R, you can do this very easily with the residuals() function. This works fine with no NAs:

> data(BOD)
> BOD
   Time demand
1    1    8.3
2    2   10.3
3    3   19.0
4    4   16.0
5    5   15.6
6    7   19.8
> residuals(lm(demand ~ Time, data=BOD))
         1          2         3         4          5          6
-1.9428571 -1.6642857 5.3142857 0.5928571 -1.5285714 -0.7714286

However, there’s a slight difficulty when there are NAs in the data. If you assume the residuals will have the same dimensions and order of elements as the input data, your stuff might break.

> BOD$demand[5] <- NA
residuals(lm(demand ~ Time, data=BOD))
         1          2         3         4          6 
-1.9716981 -1.8084906 5.0547170 0.2179245 -1.4924528

I used to use a small work-around that used the fact that residuals() saves the row names of the original data as names in the residual vector. Then I found that you could get the desired behaviour — at least, what I want is usually for the function to return the a vector of the same length as the input, where NA data points give NA residual values — by simply putting in a na.action argument, like so:

> residuals(lm(demand ~ Time, data=BOD, na.action=na.exclude))
         1          2         3        4         5          6
-1.9716981 -1.8084906 5.0547170 0.2179245       NA -1.4924528

Sometimes, R is pretty neat.

Tre rekommendationer

I brist på egna poster (ännu ett semesterprojekt som inte riktigt blev av) tänkte jag ge några förslag för den som vill fylla vetenskapsnördkvoten:

Sund skepsis gör ungefär vad jag brukar göra med nyhetsartiklar om biologi — men oftare, mer systematiskt och koncentrerat på medicin — det vill säga tittar närmare på olika notiser om vetenskap och spårar deras källor. Det är trevligt och mycket bekvämare än att själv söka upp referenser (även om författaren håller sig med ett betygssystem som jag inte riktigt förstår vitsen med).

The Biofashion Blog skrivs av två linköpingsstudenter, varav jag haft nöjet att undervisa en i genuttrycksanalys förra terminen. Det rör sig om precis vad det låter som — en blogg om mode och bioteknik. (Såhär cool kan du bli om du läser något av biologiprogrammen vid LiU — lägg märke till att det står ”DNA-extraktion från kiwi” på tavlan; det var en labbdemonstration som Malin och Kristina körde för besökande högstadieelever.)

Abbie Smith (a.k.a. erv, min favoritvirusbloggare!) presenterar immunförsvaret och virus för lekmän med intresse för evolution — skojigt, och påminner mig om att en verkligen borde kolla upp det adaptiva immunförsvaret … (Missa inte när hon liknar B-celler vid maffiachefer och klädsnobbar.)

Om zebrafinkars relationer 2: alleler och hårda ord

Finksåpan fortsätter. Igår kom vi så långt som till första stycket av TT-artikeln; varför inte gå vidare till det andra? En övning till läsaren — finn fem fel. Jag kommer strax klaga på alla de kursiverade orden och uttrycken. Gissa gärna varför!

Tendensen att hoppa över skaklarna skulle med andra ord vara genetiskt styrd. Hannar som inte nöjer sig med sin äkta hälft utan gärna jagar efter andra honor, för över sitt beteende till sina döttrar — som när de blivit vuxna ständigt sviker sina partners.

Redo? Vi börjar med den lätta biten. Att tendensen att para sig utanför paret till viss del går i familjen betyder såklart sannolikt att den har en genetisk komponent — men ”genetiskt styrd” är väl ändå att ta i? Den självklara motfrågan till alla påståenden om genetiska grunder för beteende handlar om miljöns effekter. Så kanske det kan vara på sin plats att se hur stor genetisk effekt författarna faktiskt rapporterar.

Som en del av sina statistiska beräkningar uppskattar Forstmeier & co heritabiliteten för de beteenden de har mätt. Heritabilitet mäter hur stor del av variationen i en egenskap som beror på släktskap. Det där är värt att ta en gång till. Om vi mäter hur mycket en egenskap (som till exempel hur mycket en ung zebrafinkhane sjunger när han får träffa en  hona) varierar i en population och vet släktskapet mellan individerna, så kan vi uppskatta hur stor del av variationen som kan förklaras av genetiska faktorer (alltså släktskap) och hur mycket som beror på miljöfaktorer (allt annat).

För att hitta heritabiliteten får vi titta i Supporting Information — liksom DVD-filmer har vetenskapliga artiklar ofta extramaterial, men tyvärr sällan intervjuer med författarna. Där kan vi se att de gjort om sina beräkningar flera gånger på olika sätt, för att försäkra sig att resultaten inte hänger på någon detalj i metodvalet. Men oavsett vilket, och för vilket beteendemått det än gäller, så uppskattar de heritabiliteten till högst 0.2. Så, i den här populationen förklarar genetiken på sin höjd en femtedel av variationen i parningsbeteende. Det är en respektabel siffra, men den understryker ändå att ärftlighet alls inte är den allt överskuggande faktorn — inte ens i en population i fångenskap under relativt kontrollerade förhållanden. Det spelar ingen roll, för arbetet ifråga handlar inte om att förklara promiskuitet i allmänhet! (Det ser ut som ett självklart påstående, men om vi hinner komma till slutet av TT-artikeln kommer vi se att så inte är fallet.)

Nästa punkt: hanarna som ”för över sitt beteende till sina döttrar”. Är inte det ett ganska konstigt sätt att uttrycka att någonting är ärftligt? När någon gör en stor affär av att påpeka att något går i arv just från den ena föräldern brukar det vara fråga om något annat än vanlig gammaldags genetik — till exempel en föräldraeffekt eller någon sorts påverkan under uppväxten. Men så är det inte i det här fallet — författarna tittade inte specifikt efter faderseffekter, och de flyttade ägg mellan bon för att kontrollera effekten av att bli omhändertagen av ett visst föräldrapar. Vad de intresserade sig för var genetiskt arv — och det går naturligtvis inte bara från far till dotter utan också från mor till dotter eller son.

Nu till det viktigaste: ”äkta hälft”, ”inte nöjer sig”, ”ständigt sviker” — och allt tjat om ”otrohet”. Det här är också något som borde få det att krylla längs läsarens ryggrad (tyvärr inte bara över populärvetenskapliga utan rätt ofta också fackvetenskapliga texter). TT-artikeln svänger sig med förtjusning med värdeladdade ord som helt enkelt är osakliga och inte hör hemma i en text om djurs beteende. Sluta baktala de stackars zebrafinkarna!

Kan zebrafinkar vara otrogna? Uppfattar de parbildning som något som liknar ett äktenskap? Känner de sig svikna? Egentligen är det också en vetenskaplig fråga — alltså, ifall det zebrafinkar gör och känner i samband med parningar utanför paret är tillräckligt likt mänsklig otrohet för att kunna anses analogt. Men det är nog ingen som vet tillräckligt om zebrafinkars medvetande och känsloliv för att kunna svara. Och det spelar ingen roll, för arbetet ifråga handlar inte om otrohet, allra minst mänsklig sådan. Människan är inte skapelsens krona, och ibland får vi faktiskt acceptera att fåglars sociala liv är mycket mer intressant.

Till slut är det i alla fall Svenska dagbladets rubrik som är sämst: Otrohet kan finnas i generna.

För även om vi accepterar förbehållen ovan och känner oss redo för att påstå att en genetisk variant kanske påverkar tendenser till vad vi vill kalla otrohet, så är det ändå inte frågan om någon otrohetsgen — på sin höjd en otrohetsallel. Vi pratar hela tiden om skillnader mellan individer med olika varianter av en viss gen. Det blir alltså några alleler som är kopplade till högre risk för otrohet och några som är kopplade till lägre risk. Genen ifråga har förmodligen någonting med parbildning att göra eller kanske med sexdrift, vem vet.

Vi tjatar en del om det här, inte sant? Men det är viktigt — för när vi håller det här med alleler och variation i minnet framstår prat om att något ”finns i generna” som rätt svagsint. Visst, DNA-sekvenserna för de proteiner som krävs för att bygga upp ett nervsystem som gör att organismen kan bilda starka band till en partner eller utföra promiskuösa beteenden finns i generna. Och om något ändras i de generna skulle det kunna få individen ifråga att bilda starkare eller svagare parbildningar eller vara mer eller mindre promiskuös. Det behöver inte vara mer magiskt eller mer upprörande än så.

Om zebrafinkars relationer 1: referensen de glömde

Inte hänt så mycket här på ett tag, eller hur? Så låt oss sätta igång genast. Igår publicerade DN med flera en TT-artikel om en vetenskaplig artikel — och genast börjar någon sorts förväxlingskomedi som retar mig så till den milda grad att det borde skrivas något om den. Vi börjar med steg ett: att hitta den faktiska artikeln. Den är nämligen inte bara publicerad i en ganska häftig tidskrift, den är också öppet tillgänglig även för alla som inte betalar för tidskriften (ett alternativ som författarna förmodligen betalat dyrt för, så varför inte dra nytta av det).

Wolfgang Forstmeier, Katrin Martin, Elisabeth Bolund, Holger Schielzeth, Bart Kempenaers. (2011) Female extrapair mating behavior can evolve via indirect selection on males. PNAS  doi: 10.1073/pnas.1103195108

Det handlar alltså, som rubriken antyder, om zebrafinkar, parbildning och parning utanför parbildningen. Blixtsammanfattning: zebrafinkar är socialt monogama och lever tillsammans hela livet, men de parar sig också ibland med andra individer än sin partner. Det finns viss variation i tendensen att para sig med andra — och variation är, som bekant, genetikens livsluft! — och en del av variationen går att föra tillbaka på genetik. Promiskuitet går alltså i släkten. Vidare verkar det vara i stort sett samma genetiska varianter som får en zebrafink att para sig mer eller mindre utanför paret, oavsett om hen är hane eller hona.

Samma genetik i båda könen — det låter kanske inte så förvånande. Varför är det viktigt? Då måste vi prata lite om könsurvalsteori. Det finns nämligen en intressant dikotomi hos sexuellt reproducerande varelser: det brukar alltid finnas två typer av könsceller — de stora, som kallas ägg, och de små, som kallas spermier. (Det gäller många, men inte riktigt alla — bland annat en del alger har två typer av lika stora könsceller, och så har bakterier och virus sina egna motsvarigheter till sexuell reproduktion. Det är hur coolt som helst, men det är inte ämnet för dagen.) Ändå finns det en imponerande variation i vilka typer av kroppar det är som producerar de där könscellerna. Könsurval (sexual selection — på svenska också sexuell selektion, men jag tycker det klingar lite fånigt) handlar om att med evolutionsbiologins hjälp förklara hur olika köns- och sexualmönster uppstår.

Det är nästan aldrig lätt att säkert veta om någon egenskap (särskilt om det är fråga om ett beteende) finns där för att det varit gynnsamt för djurets förmåga att fortplanta sig, alltså främjats av naturligt urval. Det är förresten vad som brukar kallas en anpassning eller en adaptation — någonting som sprider sig eller har spridit sig via evolution genom naturligt urval. Alternativet är såklart att det blivit så utan att det är något speciellt med egenskapen ifråga — det skulle kunna vara en sidoeffekt av någon annan adaptation, eller så har det bara råkat bli så av någon historisk slump.

Så, låt oss fortsätta dagens övning med att titta på de två sammanfattningarna — först PNAS-artikeln och sedan TT-artikeln.

In many species that form socially monogamous pair bonds, a considerable proportion of the offspring is sired by extrapair males. This observation has remained a puzzle for evolutionary biologists: although mating outside the pair bond can obviously increase the offspring production of males, the benefits of such behavior to females are less clear, yet females are known to actively solicit extrapair copulations. For more than two decades adaptionist explanations have dominated the discussions, yet remain controversial, and genetic constraint arguments have been dismissed without much consideration. An intriguing but still untested hypothesis states that extrapair mating behavior by females may be affected by the same genetic variants (alleles) as extrapair mating behavior by males, such that the female behavior could evolve through indirect selection on the male behavior. Here we show that in the socially monogamous zebra finch, individual differences in extrapair mating behavior have a hereditary component. Intriguingly, this genetic basis is shared between the sexes, as shown by a strong genetic correlation between male and female measurements of extrapair mating behavior. Hence, positive selection on males to sire extrapair young will lead to increased extrapair mating by females as a correlated evolutionary response. This behavior leads to a fundamentally different view of female extrapair mating: it may exist even if females obtain no net benefit from it, simply because the corresponding alleles were positively selected in the male ancestors. (Wolfgang Forstmeier m.fl.)

Okej. Det var lite väl kompakt. Vi tar det i punktform:

  1. Flera arter av parbildande fåglar får rätt många ungar med andra än sin partner.
  2. Evolutionsbiologer är lite fundersamma över varför, särskilt från honornas perspektiv. Tanken är nämligen att honans fortplantning förmodligen begränsas av mängden ägg hon kan producera  — det är att lägga ägg som är den svåra biten, inte att hitta en partner, så när hon redan har en, vad ska hon med fler hanar till?
  3. Det finns ett gäng olika hypoteser om vad som är fördelen med att vara lite promiskuös — alltså olika hypoteser om parning utanför paret som en adaptation.
  4. En annan hypotes är att honors parning utanför paret inte är en adaptation i sig, utan en bieffekt av promiskuitet på hansidan. Honornas fortplantningsförmåga skulle kunna direkt motverkas av en genetisk variant som gör dem lite mer promiskuösa — så länge den också gör hanar lite mer promiskuösa, så att deras bröder får fler ungar.
  5. I så fall måste det finnas en genetisk korrelation mellan hanars och honors tendens att para sig utanför paret.
  6. De studerade parningsbeteenden hos population zebrafinkar och hittade just ett sådant samband.
  7. Det är alltså möjligt att zebrafinkhonors parning utanför paret är en genetisk bieffekt av selektion på hanar.

Låt mig kort ge en åsikt om artikeln (även om åsikter är överskattade): Frågan om adaptation eller inte  är såklart intressant i sig… Men för att den icke-adaptiva hypotesen ska stå sig krävs faktiskt att genetiken fungerar på ett visst sätt. Och författarna har gjort ett stort och, vad jag kan se, solitt arbete för att pröva den genetiska delen av hypotesen. Utmärkt! På så sätt är det artikelns styrka att den inte tittar efter det adaptiva, neutrala eller möjligen maladaptiva med promiskuitet utan handlar om vad som är genetiskt möjligt.

Hos många djurarter bedrar honorna sina äkta makar. Frågan är varför. Vad vinner de på beteendet? Svaret kan vara att de kanske inte vinner någonting. Enligt en ny studie har de ärvt otroheten av sina otrogna pappor. (Roland Johansson, TT)

Den här ingressen illustrerar perfekt vad som är så frustrerande med texter om evolutionsbiologi. För när den läses med försiktiga ögon så är det ett i sak hyfsat korrekt referat. Huvudslutsatsen är till och med där. Men samtidigt är allt så osmidigt uttryckt att det öppnar för alla möjliga missförstånd. ”Vad vinner de på beteendet?” kanske är en okej omskrivning för ”Är det här beteendet en adaptation?” Och alla förstår att när fåglarna ”bedrar… sina äkta makar” menas att de parar sig med andra hanar, inte att de hänger på den dejtingsajt för otrohet som Googlereklamen förmodligen kopplar till den här bloggposten. Men det är ändå ett exempel på vetenskapstext när den trasslar in sig i sig själv — full av metaforer som leder läsaren rakt åt skogen snarare än åt rätt håll. (Tyvärr är jag inte övertygad om att den här serien blir någon bättre guide, men vi kan ju åtminstone göra ett försök.)

Imorgon tänkte jag att vi kunde prata lite mer om laddat språkbruk — efterhand kanske vi till och med kommer fram till vad Forstmeier & co faktiskt gjort.

Från Uppsala

Det här är ingen bloggpost med någon större substans, utan bara ett glatt utrop från Uppsala, där jag är på en workshop om QTL-kartläggning (genetisk kartläggning av kvantitativa egenskaper — alltså sådana fenotyper som kan mätas på någon mer sofistikerad skala än på/av) på EBC. Första dagen har bestått av fantastiska föreläsningar, särskilt John Willis om gyckelblomman (Mimulus guttatus) och dess genetik, och Erik Postma om inavel och deras sjukt imponerande arbete med sångsparvarna (Melospiza melodia) på Mandarte Island. (Middagsdiskussion om genetisk annotation och genuttryckskartläggning inte att förglömma.)

Imorgon ser vi fram emot mer QTL, RNA-mätningar och massivt parallell DNA-sekvensering!